Alytaus evangelikų reformatų parapija - viena iš jauniausiųjų. Nors užregistruota 2000 m., visą dešimtmetį šioje parapijoje patarnavimai nevyko. Tik 2011m. Alytaus evangelikų reformatų parapijoje ėmė lankytis Vilniaus parapijos dvasininkai, o 2012m. šiai parapijai Sinodas paskyrė administratorių, generalinį superintendentą kun.Tomą Šerną.
2013m. vasario 24d. įvyko Alytaus parapijos sesija, kurioje seniūnų Valdybos pirmininke išrinkta Skaidra Užalienė, ji kartu su kunigu-administratoriumi bei valdybos nariais Audra Trunciene bei Egle Matulevičiene sudaro Alytaus ev. ref. parapijos vietinę vadovybę - Valdybą. Delegate į Sinodą išrinkta Skaidra Užalienė, delegate-kandidate Eglė Matulevičienė.